Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb1P28230 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb1P28230 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms