Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-DMaP28078 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-DMaP28078 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms