Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde6aP27664 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms