Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb2P27090 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tgfb2P27090 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tgfb2P27090 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms