Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfraP26618 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms