Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgaP26339 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgaP26339 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgaP26339 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms