Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd11P23813 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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