Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ggta1P23336 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ggta1P23336 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ggta1P23336 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ggta1P23336 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ggta1P23336 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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