Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PparaP23204 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PparaP23204 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PparaP23204 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PparaP23204 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PparaP23204 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PparaP23204 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PparaP23204 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PparaP23204 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PparaP23204 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PparaP23204 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PparaP23204 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PparaP23204 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PparaP23204 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PparaP23204 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PparaP23204 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PparaP23204 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PparaP23204 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PparaP23204 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms