Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx3P23198 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx3P23198 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms