Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Eif3aP23116 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3aP23116 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3aP23116 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3aP23116 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3aP23116 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms