Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eP22646 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms