Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clk1P22518 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clk1P22518 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms