Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou3f1P21952 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms