Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox5bP19536 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms