Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a1P19437 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms