Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnc1P19123 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms