Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ighv3-6P18531 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ighv3-6P18531 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms