Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tph1P17532 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms