Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptan1P16546 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptan1P16546 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms