Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ass1P16460 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ass1P16460 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ass1P16460 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ass1P16460 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms