Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna1P16388 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna1P16388 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms