Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrphP15331 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrphP15331 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PrphP15331 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrphP15331 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrphP15331 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrphP15331 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrphP15331 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrphP15331 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrphP15331 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrphP15331 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrphP15331 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrphP15331 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrphP15331 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrphP15331 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrphP15331 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrphP15331 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrphP15331 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrphP15331 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrphP15331 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrphP15331 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrphP15331 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrphP15331 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrphP15331 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrphP15331 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrphP15331 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms