Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms