Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtcP11725 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtcP11725 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtcP11725 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtcP11725 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtcP11725 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtcP11725 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtcP11725 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OtcP11725 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OtcP11725 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtcP11725 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtcP11725 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtcP11725 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtcP11725 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.7 ms