Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga5P11688 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga5P11688 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga5P11688 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms