Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp1P11438 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp1P11438 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms