Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaraP11416 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaraP11416 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaraP11416 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaraP11416 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaraP11416 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaraP11416 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaraP11416 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaraP11416 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RaraP11416 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaraP11416 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaraP11416 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaraP11416 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RaraP11416 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaraP11416 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaraP11416 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RaraP11416 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RaraP11416 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaraP11416 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaraP11416 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaraP11416 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaraP11416 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaraP11416 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaraP11416 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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