Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolP11369 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PolP11369 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PolP11369 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PolP11369 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PolP11369 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PolP11369 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PolP11369 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PolP11369 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PolP11369 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolP11369 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolP11369 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolP11369 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms