Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lire1P11260 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms