Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl2P10148 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms