Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ndufb1P0DN34 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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