Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amd1P0DMN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms