Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna4P07351 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms