Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa7P02830 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa7P02830 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms