Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B2mP01887 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B2mP01887 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B2mP01887 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B2mP01887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B2mP01887 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B2mP01887 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B2mP01887 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B2mP01887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms