Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01667 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01667 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01667 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01667 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01667 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
P01667 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01667 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01667 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01667 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01667 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01667 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01667 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01667 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01667 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01667 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01667 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01667 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms