Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01649 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01649 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01649 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01649 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01649 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01649 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01649 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01649 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01649 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01649 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01649 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms