Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abl1P00520 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abl1P00520 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms