Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp1O89090 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp1O89090 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms