Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setdb1O88974 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms