Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MscO88940 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MscO88940 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MscO88940 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MscO88940 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MscO88940 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MscO88940 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MscO88940 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MscO88940 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MscO88940 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MscO88940 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MscO88940 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms