Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tom1O88746 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tom1O88746 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tom1O88746 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tom1O88746 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tom1O88746 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tom1O88746 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms