Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmx1bO88609 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmx1bO88609 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms