Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sap30O88574 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sap30O88574 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sap30O88574 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sap30O88574 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sap30O88574 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sap30O88574 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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