Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops6O88545 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops6O88545 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops6O88545 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops6O88545 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops6O88545 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops6O88545 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms