Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AurkcO88445 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AurkcO88445 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AurkcO88445 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AurkcO88445 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AurkcO88445 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms