Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfdp1O88271 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms