Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms