Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfnO70456 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfnO70456 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SfnO70456 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SfnO70456 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SfnO70456 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SfnO70456 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SfnO70456 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfnO70456 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfnO70456 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfnO70456 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfnO70456 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfnO70456 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfnO70456 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfnO70456 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SfnO70456 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfnO70456 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms